Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MDM2Q00987 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MDM2Q00987 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms