Protein–RNA interactions for Protein: P98161

PKD1, Polycystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 4,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1P98161 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
PKD1P98161 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
PKD1P98161 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
PKD1P98161 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKD1P98161 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKD1P98161 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKD1P98161 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKD1P98161 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKD1P98161 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKD1P98161 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKD1P98161 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKD1P98161 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKD1P98161 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKD1P98161 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKD1P98161 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKD1P98161 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKD1P98161 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKD1P98161 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKD1P98161 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKD1P98161 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKD1P98161 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKD1P98161 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKD1P98161 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKD1P98161 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKD1P98161 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKD1P98161 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKD1P98161 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKD1P98161 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKD1P98161 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKD1P98161 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKD1P98161 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKD1P98161 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKD1P98161 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKD1P98161 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKD1P98161 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKD1P98161 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKD1P98161 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKD1P98161 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKD1P98161 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKD1P98161 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKD1P98161 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PKD1P98161 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKD1P98161 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKD1P98161 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKD1P98161 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKD1P98161 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKD1P98161 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKD1P98161 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKD1P98161 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKD1P98161 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PKD1P98161 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKD1P98161 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKD1P98161 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKD1P98161 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKD1P98161 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKD1P98161 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKD1P98161 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKD1P98161 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKD1P98161 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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PKD1P98161 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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PKD1P98161 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKD1P98161 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKD1P98161 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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PKD1P98161 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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PKD1P98161 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKD1P98161 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKD1P98161 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKD1P98161 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKD1P98161 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PKD1P98161 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PKD1P98161 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PKD1P98161 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PKD1P98161 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PKD1P98161 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PKD1P98161 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PKD1P98161 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PKD1P98161 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PKD1P98161 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PKD1P98161 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PKD1P98161 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PKD1P98161 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PKD1P98161 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PKD1P98161 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PKD1P98161 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PKD1P98161 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PKD1P98161 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PKD1P98161 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PKD1P98161 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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