Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED6P86452 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED6P86452 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED6P86452 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED6P86452 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED6P86452 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED6P86452 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED6P86452 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED6P86452 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED6P86452 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED6P86452 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED6P86452 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED6P86452 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBED6P86452 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBED6P86452 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms