Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
COG7P83436 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
COG7P83436 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COG7P83436 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COG7P83436 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COG7P83436 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COG7P83436 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COG7P83436 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COG7P83436 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COG7P83436 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COG7P83436 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COG7P83436 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COG7P83436 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COG7P83436 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COG7P83436 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COG7P83436 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COG7P83436 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COG7P83436 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COG7P83436 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COG7P83436 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COG7P83436 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COG7P83436 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COG7P83436 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COG7P83436 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COG7P83436 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COG7P83436 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COG7P83436 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COG7P83436 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COG7P83436 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COG7P83436 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COG7P83436 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COG7P83436 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COG7P83436 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COG7P83436 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COG7P83436 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
COG7P83436 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COG7P83436 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COG7P83436 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
COG7P83436 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COG7P83436 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COG7P83436 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COG7P83436 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COG7P83436 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COG7P83436 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COG7P83436 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COG7P83436 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
COG7P83436 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COG7P83436 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
COG7P83436 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
COG7P83436 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COG7P83436 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COG7P83436 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COG7P83436 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COG7P83436 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COG7P83436 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COG7P83436 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COG7P83436 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COG7P83436 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COG7P83436 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COG7P83436 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COG7P83436 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
COG7P83436 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COG7P83436 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COG7P83436 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COG7P83436 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COG7P83436 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COG7P83436 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COG7P83436 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG7P83436 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG7P83436 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG7P83436 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG7P83436 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG7P83436 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG7P83436 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG7P83436 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG7P83436 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG7P83436 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG7P83436 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG7P83436 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG7P83436 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG7P83436 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG7P83436 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG7P83436 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG7P83436 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG7P83436 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG7P83436 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG7P83436 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COG7P83436 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COG7P83436 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COG7P83436 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COG7P83436 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COG7P83436 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COG7P83436 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COG7P83436 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COG7P83436 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
COG7P83436 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COG7P83436 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COG7P83436 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COG7P83436 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
COG7P83436 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms