Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HTRA4P83105 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HTRA4P83105 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HTRA4P83105 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HTRA4P83105 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HTRA4P83105 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HTRA4P83105 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HTRA4P83105 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HTRA4P83105 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HTRA4P83105 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HTRA4P83105 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HTRA4P83105 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HTRA4P83105 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HTRA4P83105 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HTRA4P83105 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HTRA4P83105 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HTRA4P83105 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HTRA4P83105 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HTRA4P83105 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HTRA4P83105 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HTRA4P83105 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HTRA4P83105 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HTRA4P83105 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HTRA4P83105 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HTRA4P83105 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HTRA4P83105 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HTRA4P83105 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HTRA4P83105 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HTRA4P83105 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HTRA4P83105 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HTRA4P83105 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HTRA4P83105 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HTRA4P83105 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HTRA4P83105 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HTRA4P83105 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HTRA4P83105 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HTRA4P83105 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HTRA4P83105 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HTRA4P83105 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HTRA4P83105 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HTRA4P83105 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HTRA4P83105 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HTRA4P83105 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HTRA4P83105 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HTRA4P83105 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HTRA4P83105 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HTRA4P83105 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HTRA4P83105 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HTRA4P83105 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HTRA4P83105 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HTRA4P83105 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HTRA4P83105 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HTRA4P83105 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HTRA4P83105 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HTRA4P83105 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HTRA4P83105 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HTRA4P83105 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HTRA4P83105 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HTRA4P83105 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HTRA4P83105 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HTRA4P83105 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HTRA4P83105 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HTRA4P83105 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HTRA4P83105 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HTRA4P83105 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HTRA4P83105 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HTRA4P83105 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms