Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ASIC1P78348 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ASIC1P78348 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms