Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ACTA1P68133 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms