Protein–RNA interactions for Protein: P63267

ACTG2, Actin, gamma-enteric smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG2P63267 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACTG2P63267 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTG2P63267 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTG2P63267 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTG2P63267 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTG2P63267 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms