Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACTA2P62736 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTA2P62736 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTA2P62736 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTA2P62736 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTA2P62736 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms