Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVS71-1P61550 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVS71-1P61550 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms