Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
TMEM258P61165 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms