Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLF3P57682 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLF3P57682 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLF3P57682 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLF3P57682 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLF3P57682 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLF3P57682 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLF3P57682 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLF3P57682 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLF3P57682 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLF3P57682 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLF3P57682 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLF3P57682 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLF3P57682 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLF3P57682 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLF3P57682 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLF3P57682 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLF3P57682 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLF3P57682 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLF3P57682 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLF3P57682 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLF3P57682 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLF3P57682 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLF3P57682 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLF3P57682 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLF3P57682 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KLF3P57682 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLF3P57682 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLF3P57682 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KLF3P57682 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLF3P57682 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLF3P57682 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLF3P57682 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLF3P57682 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLF3P57682 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLF3P57682 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLF3P57682 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLF3P57682 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLF3P57682 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLF3P57682 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLF3P57682 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLF3P57682 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLF3P57682 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLF3P57682 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLF3P57682 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLF3P57682 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLF3P57682 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLF3P57682 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLF3P57682 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLF3P57682 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLF3P57682 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLF3P57682 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLF3P57682 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLF3P57682 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLF3P57682 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLF3P57682 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLF3P57682 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLF3P57682 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLF3P57682 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLF3P57682 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLF3P57682 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLF3P57682 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLF3P57682 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLF3P57682 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLF3P57682 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLF3P57682 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLF3P57682 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLF3P57682 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLF3P57682 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLF3P57682 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
KLF3P57682 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLF3P57682 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLF3P57682 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLF3P57682 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLF3P57682 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLF3P57682 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLF3P57682 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLF3P57682 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLF3P57682 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLF3P57682 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLF3P57682 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLF3P57682 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLF3P57682 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLF3P57682 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLF3P57682 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLF3P57682 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLF3P57682 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLF3P57682 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLF3P57682 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLF3P57682 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLF3P57682 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLF3P57682 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLF3P57682 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLF3P57682 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLF3P57682 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLF3P57682 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLF3P57682 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLF3P57682 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLF3P57682 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLF3P57682 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms