Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NME5P56597 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NME5P56597 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NME5P56597 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NME5P56597 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NME5P56597 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NME5P56597 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NME5P56597 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NME5P56597 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NME5P56597 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NME5P56597 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NME5P56597 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NME5P56597 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NME5P56597 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NME5P56597 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NME5P56597 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NME5P56597 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NME5P56597 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NME5P56597 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NME5P56597 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NME5P56597 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NME5P56597 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NME5P56597 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NME5P56597 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NME5P56597 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NME5P56597 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NME5P56597 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NME5P56597 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NME5P56597 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NME5P56597 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NME5P56597 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NME5P56597 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NME5P56597 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NME5P56597 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NME5P56597 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NME5P56597 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NME5P56597 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NME5P56597 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NME5P56597 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NME5P56597 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NME5P56597 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NME5P56597 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NME5P56597 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NME5P56597 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NME5P56597 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NME5P56597 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NME5P56597 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NME5P56597 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NME5P56597 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NME5P56597 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NME5P56597 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NME5P56597 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NME5P56597 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NME5P56597 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NME5P56597 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NME5P56597 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NME5P56597 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NME5P56597 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NME5P56597 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NME5P56597 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NME5P56597 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NME5P56597 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NME5P56597 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NME5P56597 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NME5P56597 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NME5P56597 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NME5P56597 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NME5P56597 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NME5P56597 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NME5P56597 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NME5P56597 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NME5P56597 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NME5P56597 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NME5P56597 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NME5P56597 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NME5P56597 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NME5P56597 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NME5P56597 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NME5P56597 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NME5P56597 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NME5P56597 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NME5P56597 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NME5P56597 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NME5P56597 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NME5P56597 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NME5P56597 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NME5P56597 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NME5P56597 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NME5P56597 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NME5P56597 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
NME5P56597 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NME5P56597 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NME5P56597 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NME5P56597 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NME5P56597 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
NME5P56597 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NME5P56597 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NME5P56597 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NME5P56597 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NME5P56597 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms