Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
AP2S1P53680 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP2S1P53680 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms