Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AP3M2P53677 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms