Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
SMARCA2P51531 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
SMARCA2P51531 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
SMARCA2P51531 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
SMARCA2P51531 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
SMARCA2P51531 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
SMARCA2P51531 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
SMARCA2P51531 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
SMARCA2P51531 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
SMARCA2P51531 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
SMARCA2P51531 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
SMARCA2P51531 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
SMARCA2P51531 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
SMARCA2P51531 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
SMARCA2P51531 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
SMARCA2P51531 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
SMARCA2P51531 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
SMARCA2P51531 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
SMARCA2P51531 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
SMARCA2P51531 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
SMARCA2P51531 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
SMARCA2P51531 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
SMARCA2P51531 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
SMARCA2P51531 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
SMARCA2P51531 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
SMARCA2P51531 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
SMARCA2P51531 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
SMARCA2P51531 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC36.15■■■■□ 3.38
SMARCA2P51531 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
SMARCA2P51531 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
SMARCA2P51531 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
SMARCA2P51531 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
SMARCA2P51531 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
SMARCA2P51531 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
SMARCA2P51531 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
SMARCA2P51531 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
SMARCA2P51531 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
SMARCA2P51531 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
SMARCA2P51531 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
SMARCA2P51531 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
SMARCA2P51531 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
SMARCA2P51531 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
SMARCA2P51531 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
SMARCA2P51531 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
SMARCA2P51531 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
SMARCA2P51531 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
SMARCA2P51531 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
SMARCA2P51531 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
SMARCA2P51531 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
SMARCA2P51531 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
SMARCA2P51531 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
SMARCA2P51531 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
SMARCA2P51531 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
SMARCA2P51531 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
SMARCA2P51531 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
SMARCA2P51531 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
SMARCA2P51531 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
SMARCA2P51531 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
SMARCA2P51531 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
SMARCA2P51531 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
SMARCA2P51531 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
SMARCA2P51531 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
SMARCA2P51531 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
SMARCA2P51531 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
SMARCA2P51531 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
SMARCA2P51531 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
SMARCA2P51531 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
SMARCA2P51531 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
SMARCA2P51531 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
SMARCA2P51531 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
SMARCA2P51531 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
SMARCA2P51531 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
SMARCA2P51531 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
SMARCA2P51531 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
SMARCA2P51531 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
SMARCA2P51531 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
SMARCA2P51531 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
SMARCA2P51531 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
SMARCA2P51531 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
SMARCA2P51531 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
SMARCA2P51531 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
SMARCA2P51531 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
SMARCA2P51531 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
SMARCA2P51531 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
SMARCA2P51531 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
SMARCA2P51531 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
SMARCA2P51531 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
SMARCA2P51531 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
SMARCA2P51531 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
SMARCA2P51531 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
SMARCA2P51531 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
SMARCA2P51531 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
SMARCA2P51531 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
SMARCA2P51531 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
SMARCA2P51531 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
SMARCA2P51531 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
SMARCA2P51531 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
SMARCA2P51531 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
SMARCA2P51531 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
SMARCA2P51531 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC36.07■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms