Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB5CP51148 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB5CP51148 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms