Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MRE11P49959 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MRE11P49959 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MRE11P49959 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MRE11P49959 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MRE11P49959 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MRE11P49959 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MRE11P49959 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MRE11P49959 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MRE11P49959 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MRE11P49959 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MRE11P49959 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MRE11P49959 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MRE11P49959 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MRE11P49959 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MRE11P49959 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MRE11P49959 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MRE11P49959 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MRE11P49959 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MRE11P49959 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MRE11P49959 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MRE11P49959 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MRE11P49959 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MRE11P49959 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MRE11P49959 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MRE11P49959 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRE11P49959 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRE11P49959 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRE11P49959 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRE11P49959 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRE11P49959 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRE11P49959 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRE11P49959 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRE11P49959 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRE11P49959 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRE11P49959 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRE11P49959 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MRE11P49959 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRE11P49959 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRE11P49959 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRE11P49959 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRE11P49959 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRE11P49959 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRE11P49959 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRE11P49959 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRE11P49959 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRE11P49959 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRE11P49959 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MRE11P49959 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRE11P49959 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRE11P49959 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRE11P49959 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRE11P49959 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRE11P49959 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRE11P49959 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRE11P49959 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRE11P49959 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MRE11P49959 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRE11P49959 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MRE11P49959 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRE11P49959 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRE11P49959 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MRE11P49959 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRE11P49959 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRE11P49959 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRE11P49959 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRE11P49959 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MRE11P49959 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MRE11P49959 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRE11P49959 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRE11P49959 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRE11P49959 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRE11P49959 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRE11P49959 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRE11P49959 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRE11P49959 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MRE11P49959 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRE11P49959 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRE11P49959 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRE11P49959 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRE11P49959 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRE11P49959 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRE11P49959 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRE11P49959 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MRE11P49959 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRE11P49959 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRE11P49959 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRE11P49959 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MRE11P49959 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRE11P49959 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRE11P49959 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRE11P49959 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRE11P49959 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRE11P49959 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MRE11P49959 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRE11P49959 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRE11P49959 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRE11P49959 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MRE11P49959 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MRE11P49959 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms