Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PSEN1P49768 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PSEN1P49768 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PSEN1P49768 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PSEN1P49768 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PSEN1P49768 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PSEN1P49768 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PSEN1P49768 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSEN1P49768 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PSEN1P49768 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSEN1P49768 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PSEN1P49768 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSEN1P49768 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PSEN1P49768 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PSEN1P49768 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSEN1P49768 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSEN1P49768 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PSEN1P49768 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PSEN1P49768 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PSEN1P49768 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSEN1P49768 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSEN1P49768 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PSEN1P49768 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSEN1P49768 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSEN1P49768 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSEN1P49768 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSEN1P49768 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSEN1P49768 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSEN1P49768 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSEN1P49768 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PSEN1P49768 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PSEN1P49768 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSEN1P49768 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PSEN1P49768 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSEN1P49768 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PSEN1P49768 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSEN1P49768 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSEN1P49768 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSEN1P49768 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PSEN1P49768 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSEN1P49768 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PSEN1P49768 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PSEN1P49768 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PSEN1P49768 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PSEN1P49768 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PSEN1P49768 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PSEN1P49768 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PSEN1P49768 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PSEN1P49768 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PSEN1P49768 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PSEN1P49768 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSEN1P49768 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSEN1P49768 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSEN1P49768 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PSEN1P49768 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PSEN1P49768 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSEN1P49768 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSEN1P49768 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PSEN1P49768 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PSEN1P49768 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSEN1P49768 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSEN1P49768 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PSEN1P49768 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSEN1P49768 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PSEN1P49768 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PSEN1P49768 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PSEN1P49768 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSEN1P49768 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSEN1P49768 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSEN1P49768 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSEN1P49768 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSEN1P49768 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSEN1P49768 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSEN1P49768 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PSEN1P49768 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms