Protein–RNA interactions for Protein: P48728

AMT, Aminomethyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMTP48728 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMTP48728 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMTP48728 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMTP48728 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMTP48728 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMTP48728 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMTP48728 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMTP48728 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMTP48728 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMTP48728 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AMTP48728 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMTP48728 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMTP48728 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMTP48728 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMTP48728 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMTP48728 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMTP48728 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMTP48728 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMTP48728 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMTP48728 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMTP48728 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMTP48728 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMTP48728 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMTP48728 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMTP48728 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMTP48728 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMTP48728 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMTP48728 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMTP48728 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMTP48728 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMTP48728 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AMTP48728 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMTP48728 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMTP48728 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMTP48728 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMTP48728 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMTP48728 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMTP48728 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMTP48728 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMTP48728 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMTP48728 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMTP48728 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMTP48728 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMTP48728 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMTP48728 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMTP48728 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMTP48728 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMTP48728 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMTP48728 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMTP48728 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMTP48728 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AMTP48728 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMTP48728 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMTP48728 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMTP48728 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMTP48728 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMTP48728 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMTP48728 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMTP48728 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMTP48728 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMTP48728 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMTP48728 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMTP48728 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AMTP48728 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMTP48728 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AMTP48728 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMTP48728 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AMTP48728 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMTP48728 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMTP48728 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMTP48728 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMTP48728 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMTP48728 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMTP48728 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMTP48728 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMTP48728 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMTP48728 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMTP48728 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMTP48728 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMTP48728 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMTP48728 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AMTP48728 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AMTP48728 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMTP48728 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMTP48728 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMTP48728 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMTP48728 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMTP48728 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMTP48728 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMTP48728 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMTP48728 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMTP48728 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMTP48728 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AMTP48728 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMTP48728 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AMTP48728 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMTP48728 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMTP48728 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
AMTP48728 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AMTP48728 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms