Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCLCP48506 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCLCP48506 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GCLCP48506 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCLCP48506 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GCLCP48506 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCLCP48506 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCLCP48506 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCLCP48506 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GCLCP48506 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GCLCP48506 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCLCP48506 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCLCP48506 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCLCP48506 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GCLCP48506 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCLCP48506 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCLCP48506 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCLCP48506 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCLCP48506 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCLCP48506 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCLCP48506 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCLCP48506 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCLCP48506 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCLCP48506 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCLCP48506 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCLCP48506 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCLCP48506 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GCLCP48506 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCLCP48506 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCLCP48506 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCLCP48506 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCLCP48506 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCLCP48506 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCLCP48506 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCLCP48506 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCLCP48506 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCLCP48506 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCLCP48506 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCLCP48506 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCLCP48506 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCLCP48506 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCLCP48506 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCLCP48506 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCLCP48506 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCLCP48506 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCLCP48506 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCLCP48506 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCLCP48506 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCLCP48506 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCLCP48506 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GCLCP48506 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GCLCP48506 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCLCP48506 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCLCP48506 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCLCP48506 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCLCP48506 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCLCP48506 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCLCP48506 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCLCP48506 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCLCP48506 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCLCP48506 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCLCP48506 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GCLCP48506 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCLCP48506 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCLCP48506 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCLCP48506 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCLCP48506 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GCLCP48506 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCLCP48506 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCLCP48506 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCLCP48506 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCLCP48506 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCLCP48506 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCLCP48506 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCLCP48506 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GCLCP48506 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCLCP48506 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCLCP48506 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCLCP48506 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCLCP48506 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCLCP48506 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCLCP48506 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCLCP48506 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCLCP48506 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GCLCP48506 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GCLCP48506 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GCLCP48506 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GCLCP48506 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GCLCP48506 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GCLCP48506 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GCLCP48506 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GCLCP48506 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GCLCP48506 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GCLCP48506 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GCLCP48506 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GCLCP48506 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GCLCP48506 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GCLCP48506 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GCLCP48506 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCLCP48506 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms