Protein–RNA interactions for Protein: P47211

GALR1, Galanin receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALR1P47211 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GALR1P47211 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GALR1P47211 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GALR1P47211 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GALR1P47211 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GALR1P47211 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GALR1P47211 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GALR1P47211 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GALR1P47211 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GALR1P47211 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GALR1P47211 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GALR1P47211 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GALR1P47211 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GALR1P47211 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GALR1P47211 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GALR1P47211 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GALR1P47211 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GALR1P47211 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GALR1P47211 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GALR1P47211 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GALR1P47211 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GALR1P47211 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GALR1P47211 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GALR1P47211 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GALR1P47211 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GALR1P47211 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GALR1P47211 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GALR1P47211 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GALR1P47211 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GALR1P47211 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GALR1P47211 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GALR1P47211 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GALR1P47211 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GALR1P47211 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GALR1P47211 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GALR1P47211 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GALR1P47211 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GALR1P47211 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GALR1P47211 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GALR1P47211 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GALR1P47211 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GALR1P47211 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
GALR1P47211 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GALR1P47211 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GALR1P47211 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GALR1P47211 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GALR1P47211 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GALR1P47211 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GALR1P47211 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GALR1P47211 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GALR1P47211 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GALR1P47211 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GALR1P47211 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GALR1P47211 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GALR1P47211 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GALR1P47211 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GALR1P47211 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GALR1P47211 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GALR1P47211 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GALR1P47211 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GALR1P47211 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GALR1P47211 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GALR1P47211 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GALR1P47211 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GALR1P47211 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GALR1P47211 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GALR1P47211 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GALR1P47211 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GALR1P47211 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GALR1P47211 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GALR1P47211 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GALR1P47211 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GALR1P47211 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GALR1P47211 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GALR1P47211 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GALR1P47211 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GALR1P47211 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GALR1P47211 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GALR1P47211 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GALR1P47211 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GALR1P47211 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GALR1P47211 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GALR1P47211 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GALR1P47211 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GALR1P47211 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GALR1P47211 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GALR1P47211 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GALR1P47211 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GALR1P47211 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GALR1P47211 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GALR1P47211 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GALR1P47211 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GALR1P47211 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GALR1P47211 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GALR1P47211 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GALR1P47211 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GALR1P47211 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GALR1P47211 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GALR1P47211 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GALR1P47211 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms