Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NEDD4P46934 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NEDD4P46934 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms