Protein–RNA interactions for Protein: P46013

MKI67, Proliferation marker protein Ki-67, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKI67P46013 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKI67P46013 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKI67P46013 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKI67P46013 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKI67P46013 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKI67P46013 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKI67P46013 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKI67P46013 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKI67P46013 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKI67P46013 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKI67P46013 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKI67P46013 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKI67P46013 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKI67P46013 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKI67P46013 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKI67P46013 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKI67P46013 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MKI67P46013 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKI67P46013 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKI67P46013 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKI67P46013 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKI67P46013 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MKI67P46013 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MKI67P46013 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKI67P46013 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKI67P46013 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKI67P46013 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKI67P46013 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKI67P46013 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKI67P46013 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKI67P46013 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKI67P46013 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKI67P46013 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKI67P46013 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKI67P46013 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKI67P46013 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKI67P46013 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKI67P46013 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKI67P46013 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKI67P46013 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKI67P46013 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKI67P46013 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKI67P46013 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKI67P46013 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKI67P46013 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MKI67P46013 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKI67P46013 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKI67P46013 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKI67P46013 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKI67P46013 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKI67P46013 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKI67P46013 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKI67P46013 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKI67P46013 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MKI67P46013 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKI67P46013 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKI67P46013 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKI67P46013 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKI67P46013 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKI67P46013 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MKI67P46013 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKI67P46013 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MKI67P46013 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKI67P46013 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKI67P46013 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKI67P46013 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKI67P46013 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKI67P46013 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKI67P46013 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKI67P46013 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKI67P46013 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKI67P46013 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKI67P46013 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKI67P46013 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKI67P46013 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKI67P46013 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MKI67P46013 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKI67P46013 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKI67P46013 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKI67P46013 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKI67P46013 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MKI67P46013 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKI67P46013 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MKI67P46013 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MKI67P46013 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MKI67P46013 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MKI67P46013 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MKI67P46013 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MKI67P46013 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKI67P46013 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKI67P46013 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKI67P46013 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MKI67P46013 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKI67P46013 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKI67P46013 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MKI67P46013 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKI67P46013 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MKI67P46013 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKI67P46013 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKI67P46013 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms