Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSR1P43307 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSR1P43307 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSR1P43307 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSR1P43307 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSR1P43307 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSR1P43307 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSR1P43307 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSR1P43307 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSR1P43307 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSR1P43307 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSR1P43307 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSR1P43307 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSR1P43307 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSR1P43307 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSR1P43307 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSR1P43307 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSR1P43307 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSR1P43307 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSR1P43307 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSR1P43307 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSR1P43307 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSR1P43307 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSR1P43307 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSR1P43307 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSR1P43307 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSR1P43307 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSR1P43307 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSR1P43307 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSR1P43307 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSR1P43307 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSR1P43307 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSR1P43307 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSR1P43307 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSR1P43307 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSR1P43307 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSR1P43307 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSR1P43307 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSR1P43307 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSR1P43307 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSR1P43307 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSR1P43307 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSR1P43307 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSR1P43307 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSR1P43307 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSR1P43307 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSR1P43307 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSR1P43307 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSR1P43307 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSR1P43307 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSR1P43307 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSR1P43307 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSR1P43307 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSR1P43307 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSR1P43307 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSR1P43307 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSR1P43307 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSR1P43307 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSR1P43307 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSR1P43307 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSR1P43307 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSR1P43307 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSR1P43307 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSR1P43307 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSR1P43307 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSR1P43307 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSR1P43307 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSR1P43307 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSR1P43307 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SSR1P43307 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SSR1P43307 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSR1P43307 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSR1P43307 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSR1P43307 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSR1P43307 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSR1P43307 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSR1P43307 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SSR1P43307 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSR1P43307 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSR1P43307 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSR1P43307 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSR1P43307 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSR1P43307 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSR1P43307 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSR1P43307 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSR1P43307 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSR1P43307 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSR1P43307 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSR1P43307 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSR1P43307 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSR1P43307 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSR1P43307 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SSR1P43307 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSR1P43307 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSR1P43307 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SSR1P43307 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSR1P43307 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SSR1P43307 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSR1P43307 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSR1P43307 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms