Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC1A2P43004 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC1A2P43004 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC1A2P43004 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC1A2P43004 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC1A2P43004 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC1A2P43004 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC1A2P43004 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC1A2P43004 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC1A2P43004 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC1A2P43004 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC1A2P43004 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC1A2P43004 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC1A2P43004 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC1A2P43004 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC1A2P43004 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC1A2P43004 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC1A2P43004 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC1A2P43004 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC1A2P43004 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC1A2P43004 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC1A2P43004 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC1A2P43004 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC1A2P43004 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC1A2P43004 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC1A2P43004 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC1A2P43004 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC1A2P43004 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC1A2P43004 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC1A2P43004 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC1A2P43004 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC1A2P43004 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms