Protein–RNA interactions for Protein: P42261

GRIA1, Glutamate receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA1P42261 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GRIA1P42261 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms