Protein–RNA interactions for Protein: P42126

ECI1, Enoyl-CoA delta isomerase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECI1P42126 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECI1P42126 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECI1P42126 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECI1P42126 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ECI1P42126 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ECI1P42126 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ECI1P42126 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ECI1P42126 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ECI1P42126 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ECI1P42126 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ECI1P42126 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ECI1P42126 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ECI1P42126 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ECI1P42126 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ECI1P42126 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ECI1P42126 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ECI1P42126 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ECI1P42126 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ECI1P42126 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ECI1P42126 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ECI1P42126 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ECI1P42126 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ECI1P42126 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ECI1P42126 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ECI1P42126 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ECI1P42126 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ECI1P42126 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ECI1P42126 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ECI1P42126 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECI1P42126 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECI1P42126 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECI1P42126 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECI1P42126 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECI1P42126 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECI1P42126 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECI1P42126 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECI1P42126 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECI1P42126 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECI1P42126 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECI1P42126 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECI1P42126 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECI1P42126 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECI1P42126 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECI1P42126 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECI1P42126 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECI1P42126 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECI1P42126 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ECI1P42126 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ECI1P42126 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECI1P42126 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECI1P42126 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECI1P42126 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECI1P42126 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECI1P42126 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECI1P42126 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECI1P42126 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECI1P42126 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECI1P42126 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECI1P42126 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECI1P42126 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ECI1P42126 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECI1P42126 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECI1P42126 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECI1P42126 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ECI1P42126 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECI1P42126 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECI1P42126 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECI1P42126 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECI1P42126 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECI1P42126 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECI1P42126 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECI1P42126 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECI1P42126 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECI1P42126 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECI1P42126 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECI1P42126 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECI1P42126 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ECI1P42126 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECI1P42126 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECI1P42126 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECI1P42126 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECI1P42126 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECI1P42126 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECI1P42126 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECI1P42126 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECI1P42126 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECI1P42126 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECI1P42126 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ECI1P42126 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECI1P42126 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECI1P42126 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECI1P42126 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECI1P42126 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECI1P42126 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECI1P42126 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECI1P42126 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ECI1P42126 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECI1P42126 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECI1P42126 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ECI1P42126 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms