Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOBEC1P41238 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOBEC1P41238 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms