Protein–RNA interactions for Protein: P40227

CCT6A, T-complex protein 1 subunit zeta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT6AP40227 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT6AP40227 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT6AP40227 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT6AP40227 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT6AP40227 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT6AP40227 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT6AP40227 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT6AP40227 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT6AP40227 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT6AP40227 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCT6AP40227 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT6AP40227 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT6AP40227 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT6AP40227 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT6AP40227 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT6AP40227 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT6AP40227 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT6AP40227 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT6AP40227 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT6AP40227 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT6AP40227 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT6AP40227 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT6AP40227 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT6AP40227 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT6AP40227 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT6AP40227 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCT6AP40227 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT6AP40227 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT6AP40227 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT6AP40227 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT6AP40227 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT6AP40227 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT6AP40227 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT6AP40227 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT6AP40227 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT6AP40227 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT6AP40227 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT6AP40227 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT6AP40227 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT6AP40227 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT6AP40227 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT6AP40227 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCT6AP40227 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT6AP40227 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT6AP40227 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT6AP40227 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT6AP40227 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT6AP40227 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT6AP40227 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT6AP40227 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT6AP40227 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT6AP40227 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT6AP40227 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT6AP40227 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT6AP40227 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT6AP40227 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT6AP40227 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT6AP40227 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT6AP40227 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT6AP40227 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT6AP40227 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT6AP40227 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT6AP40227 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT6AP40227 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT6AP40227 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT6AP40227 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT6AP40227 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCT6AP40227 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCT6AP40227 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT6AP40227 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT6AP40227 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT6AP40227 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT6AP40227 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT6AP40227 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT6AP40227 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT6AP40227 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT6AP40227 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT6AP40227 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT6AP40227 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT6AP40227 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT6AP40227 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT6AP40227 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT6AP40227 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT6AP40227 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCT6AP40227 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT6AP40227 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT6AP40227 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT6AP40227 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT6AP40227 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT6AP40227 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT6AP40227 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT6AP40227 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT6AP40227 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT6AP40227 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT6AP40227 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCT6AP40227 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT6AP40227 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT6AP40227 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT6AP40227 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCT6AP40227 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.3 ms