Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK1P39086 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK1P39086 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK1P39086 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIK1P39086 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GRIK1P39086 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GRIK1P39086 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GRIK1P39086 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRIK1P39086 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRIK1P39086 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRIK1P39086 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRIK1P39086 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRIK1P39086 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRIK1P39086 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GRIK1P39086 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GRIK1P39086 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRIK1P39086 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GRIK1P39086 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRIK1P39086 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GRIK1P39086 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRIK1P39086 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIK1P39086 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms