Protein–RNA interactions for Protein: P37840

SNCA, Alpha-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAP37840 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNCAP37840 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNCAP37840 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNCAP37840 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNCAP37840 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNCAP37840 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNCAP37840 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNCAP37840 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNCAP37840 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNCAP37840 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNCAP37840 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNCAP37840 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNCAP37840 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNCAP37840 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNCAP37840 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNCAP37840 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNCAP37840 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNCAP37840 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNCAP37840 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNCAP37840 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SNCAP37840 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNCAP37840 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNCAP37840 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNCAP37840 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNCAP37840 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNCAP37840 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNCAP37840 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNCAP37840 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNCAP37840 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNCAP37840 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNCAP37840 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNCAP37840 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNCAP37840 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SNCAP37840 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNCAP37840 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNCAP37840 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNCAP37840 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNCAP37840 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNCAP37840 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNCAP37840 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNCAP37840 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNCAP37840 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNCAP37840 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNCAP37840 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNCAP37840 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNCAP37840 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNCAP37840 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNCAP37840 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNCAP37840 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SNCAP37840 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNCAP37840 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNCAP37840 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNCAP37840 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNCAP37840 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNCAP37840 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNCAP37840 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SNCAP37840 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNCAP37840 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNCAP37840 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNCAP37840 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNCAP37840 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNCAP37840 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNCAP37840 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SNCAP37840 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNCAP37840 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNCAP37840 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNCAP37840 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNCAP37840 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNCAP37840 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNCAP37840 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNCAP37840 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNCAP37840 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNCAP37840 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNCAP37840 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNCAP37840 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNCAP37840 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNCAP37840 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNCAP37840 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNCAP37840 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNCAP37840 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNCAP37840 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNCAP37840 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNCAP37840 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNCAP37840 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNCAP37840 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNCAP37840 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNCAP37840 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNCAP37840 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNCAP37840 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNCAP37840 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNCAP37840 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNCAP37840 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNCAP37840 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNCAP37840 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNCAP37840 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNCAP37840 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNCAP37840 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNCAP37840 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNCAP37840 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNCAP37840 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms