Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NUP62P37198 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NUP62P37198 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NUP62P37198 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NUP62P37198 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NUP62P37198 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NUP62P37198 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NUP62P37198 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NUP62P37198 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NUP62P37198 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NUP62P37198 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NUP62P37198 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NUP62P37198 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NUP62P37198 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP62P37198 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP62P37198 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP62P37198 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP62P37198 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP62P37198 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP62P37198 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP62P37198 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP62P37198 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP62P37198 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP62P37198 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP62P37198 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP62P37198 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP62P37198 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP62P37198 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP62P37198 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP62P37198 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP62P37198 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP62P37198 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP62P37198 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP62P37198 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP62P37198 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP62P37198 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP62P37198 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP62P37198 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP62P37198 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP62P37198 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP62P37198 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP62P37198 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP62P37198 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP62P37198 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP62P37198 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP62P37198 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP62P37198 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP62P37198 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP62P37198 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP62P37198 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP62P37198 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP62P37198 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP62P37198 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP62P37198 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP62P37198 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP62P37198 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP62P37198 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP62P37198 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP62P37198 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP62P37198 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP62P37198 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP62P37198 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP62P37198 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP62P37198 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP62P37198 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP62P37198 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP62P37198 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP62P37198 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP62P37198 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP62P37198 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP62P37198 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP62P37198 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP62P37198 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP62P37198 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP62P37198 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP62P37198 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP62P37198 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP62P37198 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP62P37198 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP62P37198 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP62P37198 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP62P37198 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP62P37198 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP62P37198 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP62P37198 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP62P37198 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP62P37198 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NUP62P37198 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NUP62P37198 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NUP62P37198 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NUP62P37198 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NUP62P37198 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NUP62P37198 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NUP62P37198 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NUP62P37198 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NUP62P37198 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP62P37198 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP62P37198 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP62P37198 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NUP62P37198 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms