Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT2P35908 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT2P35908 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT2P35908 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT2P35908 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT2P35908 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT2P35908 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT2P35908 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT2P35908 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT2P35908 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT2P35908 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT2P35908 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT2P35908 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT2P35908 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT2P35908 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT2P35908 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT2P35908 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT2P35908 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT2P35908 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT2P35908 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT2P35908 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT2P35908 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT2P35908 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT2P35908 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT2P35908 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRT2P35908 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT2P35908 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT2P35908 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT2P35908 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KRT2P35908 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT2P35908 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT2P35908 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT2P35908 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT2P35908 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT2P35908 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT2P35908 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT2P35908 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT2P35908 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT2P35908 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT2P35908 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT2P35908 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT2P35908 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT2P35908 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT2P35908 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT2P35908 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT2P35908 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT2P35908 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KRT2P35908 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT2P35908 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT2P35908 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT2P35908 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT2P35908 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT2P35908 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT2P35908 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT2P35908 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT2P35908 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT2P35908 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT2P35908 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRT2P35908 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT2P35908 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT2P35908 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT2P35908 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT2P35908 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT2P35908 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT2P35908 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT2P35908 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT2P35908 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT2P35908 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT2P35908 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KRT2P35908 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT2P35908 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT2P35908 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT2P35908 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT2P35908 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT2P35908 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT2P35908 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT2P35908 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT2P35908 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT2P35908 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT2P35908 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT2P35908 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT2P35908 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT2P35908 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT2P35908 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT2P35908 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT2P35908 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT2P35908 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT2P35908 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT2P35908 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT2P35908 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT2P35908 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KRT2P35908 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT2P35908 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT2P35908 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT2P35908 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT2P35908 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT2P35908 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT2P35908 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT2P35908 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT2P35908 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms