Protein–RNA interactions for Protein: P34925

RYK, Tyrosine-protein kinase RYK, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYKP34925 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RYKP34925 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RYKP34925 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RYKP34925 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RYKP34925 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RYKP34925 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RYKP34925 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RYKP34925 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RYKP34925 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RYKP34925 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RYKP34925 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RYKP34925 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RYKP34925 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RYKP34925 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RYKP34925 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RYKP34925 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RYKP34925 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RYKP34925 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RYKP34925 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RYKP34925 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RYKP34925 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RYKP34925 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RYKP34925 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RYKP34925 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RYKP34925 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RYKP34925 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RYKP34925 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RYKP34925 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RYKP34925 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RYKP34925 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RYKP34925 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RYKP34925 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RYKP34925 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RYKP34925 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RYKP34925 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RYKP34925 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RYKP34925 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RYKP34925 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RYKP34925 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RYKP34925 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RYKP34925 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RYKP34925 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RYKP34925 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RYKP34925 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RYKP34925 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RYKP34925 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RYKP34925 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RYKP34925 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RYKP34925 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RYKP34925 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RYKP34925 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RYKP34925 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RYKP34925 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RYKP34925 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RYKP34925 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RYKP34925 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RYKP34925 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RYKP34925 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RYKP34925 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RYKP34925 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RYKP34925 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RYKP34925 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RYKP34925 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RYKP34925 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RYKP34925 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RYKP34925 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RYKP34925 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RYKP34925 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RYKP34925 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RYKP34925 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RYKP34925 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RYKP34925 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RYKP34925 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RYKP34925 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RYKP34925 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RYKP34925 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RYKP34925 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RYKP34925 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RYKP34925 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RYKP34925 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RYKP34925 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RYKP34925 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RYKP34925 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RYKP34925 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RYKP34925 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RYKP34925 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RYKP34925 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RYKP34925 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RYKP34925 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RYKP34925 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RYKP34925 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RYKP34925 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RYKP34925 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RYKP34925 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RYKP34925 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RYKP34925 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RYKP34925 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RYKP34925 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RYKP34925 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RYKP34925 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms