Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABCD1P33897 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms