Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP1P32455 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP1P32455 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP1P32455 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP1P32455 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP1P32455 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP1P32455 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP1P32455 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP1P32455 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP1P32455 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP1P32455 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP1P32455 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP1P32455 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP1P32455 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP1P32455 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP1P32455 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP1P32455 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GBP1P32455 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBP1P32455 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBP1P32455 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBP1P32455 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBP1P32455 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBP1P32455 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBP1P32455 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBP1P32455 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBP1P32455 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBP1P32455 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBP1P32455 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBP1P32455 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBP1P32455 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBP1P32455 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GBP1P32455 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBP1P32455 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBP1P32455 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBP1P32455 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBP1P32455 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBP1P32455 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBP1P32455 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBP1P32455 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBP1P32455 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBP1P32455 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GBP1P32455 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP1P32455 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP1P32455 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP1P32455 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP1P32455 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP1P32455 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP1P32455 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP1P32455 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP1P32455 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP1P32455 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP1P32455 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP1P32455 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP1P32455 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP1P32455 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP1P32455 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP1P32455 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP1P32455 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP1P32455 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP1P32455 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP1P32455 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP1P32455 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GBP1P32455 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP1P32455 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP1P32455 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP1P32455 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP1P32455 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP1P32455 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP1P32455 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP1P32455 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP1P32455 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP1P32455 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP1P32455 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP1P32455 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP1P32455 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP1P32455 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP1P32455 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP1P32455 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP1P32455 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP1P32455 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP1P32455 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP1P32455 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP1P32455 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GBP1P32455 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP1P32455 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP1P32455 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP1P32455 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP1P32455 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP1P32455 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP1P32455 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP1P32455 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP1P32455 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP1P32455 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP1P32455 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP1P32455 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP1P32455 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP1P32455 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP1P32455 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP1P32455 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GBP1P32455 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms