Protein–RNA interactions for Protein: P32340

NDI1, Rotenone-insensitive NADH-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NDI1P32340 YBP1YBR216C 2025 nt1.74□□□□□ -2.13
NDI1P32340 NOP53YPL146C 1368 nt1.73□□□□□ -2.13
NDI1P32340 OSH6YKR003W 1347 nt1.73□□□□□ -2.13
NDI1P32340 HIR3YJR140C 4947 nt1.73□□□□□ -2.13
NDI1P32340 CSN9YDR179C 489 nt1.73□□□□□ -2.13
NDI1P32340 YIL059CYIL059C 366 nt1.73□□□□□ -2.13
NDI1P32340 YKL118WYKL118W 312 nt1.73□□□□□ -2.13
NDI1P32340 PAU18YLL064C 363 nt1.73□□□□□ -2.13
NDI1P32340 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.73□□□□□ -2.13
NDI1P32340 YNL146WYNL146W 303 nt1.73□□□□□ -2.13
NDI1P32340 PAU6YNR076W 363 nt1.73□□□□□ -2.13
NDI1P32340 PXA2YKL188C 2562 nt1.73□□□□□ -2.13
NDI1P32340 LHS1YKL073W 2646 nt1.72□□□□□ -2.13
NDI1P32340 RKM1YPL208W 1752 nt1.72□□□□□ -2.13
NDI1P32340 MSH6YDR097C 3729 nt1.72□□□□□ -2.13
NDI1P32340 NHP2YDL208W 471 nt1.72□□□□□ -2.13
NDI1P32340 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.72□□□□□ -2.13
NDI1P32340 YHR210CYHR210C 1026 nt1.72□□□□□ -2.13
NDI1P32340 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt1.72□□□□□ -2.13
NDI1P32340 SEC63YOR254C 1992 nt1.72□□□□□ -2.13
NDI1P32340 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt1.71□□□□□ -2.14
NDI1P32340 YLR255CYLR255C 354 nt1.71□□□□□ -2.14
NDI1P32340 YSY6YBR162W-A 198 nt1.71□□□□□ -2.14
NDI1P32340 YCL046WYCL046W 324 nt1.71□□□□□ -2.14
NDI1P32340 CFT1YDR301W 4074 nt1.71□□□□□ -2.14
NDI1P32340 PKH3YDR466W 2697 nt1.7□□□□□ -2.14
NDI1P32340 UTP21YLR409C 2820 nt1.7□□□□□ -2.14
NDI1P32340 SAR1YPL218W 573 nt1.7□□□□□ -2.14
NDI1P32340 MON2YNL297C 4911 nt1.7□□□□□ -2.14
NDI1P32340 SWI5YDR146C 2130 nt1.7□□□□□ -2.14
NDI1P32340 HDA3YPR179C 1968 nt1.7□□□□□ -2.14
NDI1P32340 HSL1YKL101W 4557 nt1.69□□□□□ -2.14
NDI1P32340 PAU3YCR104W 375 nt1.69□□□□□ -2.14
NDI1P32340 YDR413CYDR413C 576 nt1.69□□□□□ -2.14
NDI1P32340 YER097WYER097W 330 nt1.69□□□□□ -2.14
NDI1P32340 YHL037CYHL037C 402 nt1.69□□□□□ -2.14
NDI1P32340 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt1.69□□□□□ -2.14
NDI1P32340 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt1.69□□□□□ -2.14
NDI1P32340 NUT2YPR168W 474 nt1.69□□□□□ -2.14
NDI1P32340 TFC8YPL007C 1767 nt1.69□□□□□ -2.14
NDI1P32340 EFR3YMR212C 2349 nt1.68□□□□□ -2.14
NDI1P32340 RPL35AYDL191W 363 nt1.68□□□□□ -2.14
NDI1P32340 CYC7YEL039C 342 nt1.68□□□□□ -2.14
NDI1P32340 YER088C-AYER088C-A 324 nt1.68□□□□□ -2.14
NDI1P32340 UPS1YLR193C 528 nt1.68□□□□□ -2.14
NDI1P32340 FIG2YCR089W 4830 nt1.68□□□□□ -2.14
NDI1P32340 SEY1YOR165W 2331 nt1.67□□□□□ -2.14
NDI1P32340 RPL31AYDL075W 342 nt1.67□□□□□ -2.14
NDI1P32340 SWI6YLR182W 2412 nt1.66□□□□□ -2.14
NDI1P32340 YFL032WYFL032W 321 nt1.66□□□□□ -2.14
NDI1P32340 snR36snR36 182 nt1.66□□□□□ -2.14
NDI1P32340 TBS1YBR150C 3285 nt1.66□□□□□ -2.14
NDI1P32340 ZRG17YNR039C 1818 nt1.66□□□□□ -2.14
NDI1P32340 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.65□□□□□ -2.14
NDI1P32340 LYS14YDR034C 2373 nt1.65□□□□□ -2.14
NDI1P32340 MSC6YOR354C 2079 nt1.65□□□□□ -2.14
NDI1P32340 RPL38YLR325C 237 nt1.65□□□□□ -2.15
NDI1P32340 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt1.65□□□□□ -2.15
NDI1P32340 BRR2YER172C 6492 nt1.65□□□□□ -2.15
NDI1P32340 YGR250CYGR250C 2346 nt1.65□□□□□ -2.15
NDI1P32340 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt1.64□□□□□ -2.15
NDI1P32340 YGR265WYGR265W 411 nt1.64□□□□□ -2.15
NDI1P32340 TRX1YLR043C 312 nt1.64□□□□□ -2.15
NDI1P32340 FMP23YBR047W 528 nt1.64□□□□□ -2.15
NDI1P32340 MVP1YMR004W 1536 nt1.64□□□□□ -2.15
NDI1P32340 RFX1YLR176C 2436 nt1.64□□□□□ -2.15
NDI1P32340 MDM20YOL076W 2391 nt1.63□□□□□ -2.15
NDI1P32340 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt1.63□□□□□ -2.15
NDI1P32340 MAM33YIL070C 801 nt1.63□□□□□ -2.15
NDI1P32340 TAR1YLR154W-C 375 nt1.63□□□□□ -2.15
NDI1P32340 COA6YMR244C-A 315 nt1.63□□□□□ -2.15
NDI1P32340 YOP1YPR028W 543 nt1.63□□□□□ -2.15
NDI1P32340 IRE1YHR079C 3348 nt1.63□□□□□ -2.15
NDI1P32340 TDA9YML081W 3756 nt1.63□□□□□ -2.15
NDI1P32340 RIM20YOR275C 1986 nt1.63□□□□□ -2.15
NDI1P32340 TRM3YDL112W 4311 nt1.62□□□□□ -2.15
NDI1P32340 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt1.62□□□□□ -2.15
NDI1P32340 HTB2YBL002W 396 nt1.62□□□□□ -2.15
NDI1P32340 snR51snR51 107 nt1.62□□□□□ -2.15
NDI1P32340 MSH5YDL154W 2706 nt1.61□□□□□ -2.15
NDI1P32340 YML007C-AYML007C-A 111 nt1.61□□□□□ -2.15
NDI1P32340 YOR199WYOR199W 330 nt1.61□□□□□ -2.15
NDI1P32340 MUK1YPL070W 1839 nt1.61□□□□□ -2.15
NDI1P32340 CTR9YOL145C 3234 nt1.6□□□□□ -2.15
NDI1P32340 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt1.6□□□□□ -2.15
NDI1P32340 MAK10YEL053C 2202 nt1.59□□□□□ -2.15
NDI1P32340 RLM1YPL089C 2031 nt1.59□□□□□ -2.15
NDI1P32340 SRP14YDL092W 441 nt1.59□□□□□ -2.15
NDI1P32340 YFL063WYFL063W 456 nt1.59□□□□□ -2.15
NDI1P32340 RPL39YJL189W 156 nt1.59□□□□□ -2.15
NDI1P32340 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt1.59□□□□□ -2.15
NDI1P32340 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt1.59□□□□□ -2.15
NDI1P32340 STE5YDR103W 2754 nt1.59□□□□□ -2.15
NDI1P32340 ZIP1YDR285W 2628 nt1.58□□□□□ -2.16
NDI1P32340 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt1.58□□□□□ -2.16
NDI1P32340 SLY1YDR189W 2001 nt1.58□□□□□ -2.16
NDI1P32340 YDR048CYDR048C 315 nt1.58□□□□□ -2.16
NDI1P32340 PCC1YKR095W-A 267 nt1.58□□□□□ -2.16
NDI1P32340 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt1.58□□□□□ -2.16
NDI1P32340 DCP2YNL118C 2913 nt1.58□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 35.2 ms