Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCKARP32238 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCKARP32238 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCKARP32238 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCKARP32238 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCKARP32238 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCKARP32238 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCKARP32238 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCKARP32238 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCKARP32238 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCKARP32238 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCKARP32238 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCKARP32238 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCKARP32238 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCKARP32238 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCKARP32238 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCKARP32238 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCKARP32238 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCKARP32238 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCKARP32238 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCKARP32238 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCKARP32238 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCKARP32238 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCKARP32238 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCKARP32238 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCKARP32238 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCKARP32238 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCKARP32238 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCKARP32238 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCKARP32238 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCKARP32238 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCKARP32238 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCKARP32238 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCKARP32238 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCKARP32238 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCKARP32238 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCKARP32238 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCKARP32238 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCKARP32238 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCKARP32238 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCKARP32238 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCKARP32238 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCKARP32238 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCKARP32238 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCKARP32238 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCKARP32238 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKARP32238 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKARP32238 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKARP32238 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKARP32238 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKARP32238 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKARP32238 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKARP32238 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKARP32238 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKARP32238 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKARP32238 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKARP32238 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKARP32238 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKARP32238 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKARP32238 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKARP32238 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKARP32238 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKARP32238 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKARP32238 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKARP32238 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKARP32238 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKARP32238 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKARP32238 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKARP32238 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKARP32238 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKARP32238 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKARP32238 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKARP32238 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKARP32238 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKARP32238 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCKARP32238 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCKARP32238 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCKARP32238 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCKARP32238 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCKARP32238 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCKARP32238 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCKARP32238 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCKARP32238 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCKARP32238 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCKARP32238 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCKARP32238 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCKARP32238 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCKARP32238 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCKARP32238 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCKARP32238 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCKARP32238 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCKARP32238 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCKARP32238 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCKARP32238 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCKARP32238 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCKARP32238 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCKARP32238 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCKARP32238 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCKARP32238 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCKARP32238 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms