Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXA13P31271 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms