Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD40LGP29965 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms