Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD34P28906 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD34P28906 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD34P28906 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD34P28906 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD34P28906 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD34P28906 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD34P28906 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD34P28906 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD34P28906 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD34P28906 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD34P28906 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD34P28906 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CD34P28906 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD34P28906 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD34P28906 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CD34P28906 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD34P28906 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD34P28906 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD34P28906 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD34P28906 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD34P28906 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD34P28906 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD34P28906 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD34P28906 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD34P28906 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD34P28906 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD34P28906 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD34P28906 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD34P28906 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD34P28906 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD34P28906 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD34P28906 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD34P28906 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD34P28906 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD34P28906 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD34P28906 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD34P28906 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD34P28906 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD34P28906 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD34P28906 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD34P28906 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD34P28906 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD34P28906 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD34P28906 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD34P28906 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD34P28906 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD34P28906 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD34P28906 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD34P28906 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD34P28906 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD34P28906 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD34P28906 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD34P28906 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD34P28906 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD34P28906 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD34P28906 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD34P28906 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD34P28906 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD34P28906 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD34P28906 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD34P28906 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD34P28906 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD34P28906 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CD34P28906 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CD34P28906 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CD34P28906 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CD34P28906 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CD34P28906 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CD34P28906 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CD34P28906 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
CD34P28906 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD34P28906 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD34P28906 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD34P28906 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD34P28906 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD34P28906 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD34P28906 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD34P28906 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD34P28906 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD34P28906 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD34P28906 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD34P28906 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD34P28906 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD34P28906 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD34P28906 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD34P28906 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD34P28906 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD34P28906 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD34P28906 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD34P28906 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD34P28906 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD34P28906 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD34P28906 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD34P28906 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD34P28906 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD34P28906 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD34P28906 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD34P28906 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD34P28906 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms