Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXD10P28358 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXD10P28358 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms