Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PSMB9P28065 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PSMB9P28065 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms