Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
HMGB2P26583 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HMGB2P26583 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms