Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMO2P25791 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMO2P25791 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMO2P25791 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMO2P25791 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LMO2P25791 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LMO2P25791 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO2P25791 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO2P25791 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO2P25791 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO2P25791 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO2P25791 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO2P25791 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO2P25791 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO2P25791 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO2P25791 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO2P25791 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO2P25791 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO2P25791 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO2P25791 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO2P25791 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO2P25791 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO2P25791 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO2P25791 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO2P25791 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO2P25791 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO2P25791 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO2P25791 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO2P25791 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO2P25791 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO2P25791 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO2P25791 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO2P25791 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO2P25791 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LMO2P25791 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMO2P25791 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMO2P25791 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMO2P25791 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMO2P25791 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMO2P25791 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMO2P25791 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMO2P25791 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMO2P25791 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMO2P25791 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMO2P25791 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMO2P25791 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMO2P25791 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMO2P25791 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMO2P25791 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMO2P25791 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMO2P25791 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMO2P25791 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMO2P25791 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMO2P25791 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMO2P25791 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMO2P25791 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMO2P25791 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMO2P25791 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LMO2P25791 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LMO2P25791 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LMO2P25791 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LMO2P25791 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LMO2P25791 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LMO2P25791 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LMO2P25791 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LMO2P25791 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMO2P25791 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMO2P25791 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMO2P25791 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMO2P25791 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMO2P25791 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMO2P25791 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LMO2P25791 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMO2P25791 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMO2P25791 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMO2P25791 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMO2P25791 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMO2P25791 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMO2P25791 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMO2P25791 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMO2P25791 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LMO2P25791 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMO2P25791 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMO2P25791 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMO2P25791 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMO2P25791 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMO2P25791 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LMO2P25791 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LMO2P25791 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMO2P25791 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMO2P25791 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMO2P25791 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMO2P25791 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMO2P25791 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMO2P25791 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMO2P25791 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMO2P25791 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMO2P25791 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMO2P25791 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LMO2P25791 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms