Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCNE1P24864 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCNE1P24864 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms