Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGS1P23219 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms