Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
FGFR3P22607 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms