Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EPHA1P21709 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms